經歷十數年之考古發掘工作，南科出土文物之質與量均有驚人發現。 現有南科園區考古發掘成果，出土之考古標本概分為四類，分別為人骨標本及其葬具、生態標本、遺物標本以及現象提取標本。 展示空間特別為觀眾呈現鮮少出現在公眾眼前的博物館文物保存與維護工作。 以南科考古遺址的墓葬遺跡出土流程為例，說明考古遺物從現場發掘進行的工作直到進入博物館後的維護、保存過程。 出土文物整理工作耗日費時，需大量人力、物力資源投入，南科考古館建館後更需要充足的研究成果，以進一步推動展示計畫。